Sea Shepherds patrullbåt Havskrigare hade tillbringat två veckor på jakt efter Hong Long Fisheries/Pingtan Marine Enterprises flotta och informerade polisen när den hade lokaliserats.
Fartygen ankrades utanför Coms kust i Östtimor när gryningsrädet ägde rum den 9 september. Flottan var licensierad för allmänt fiske men misstänktes för att ha missbrukat licensvillkoren en gång utom synhåll.
Läs också: Sea Shepherd på anti-tjuvskyttepatrull i Tuvalu
Östtimors nationella polis (PNTL) begärde hjälp av Havskrigare och en Sea Shepherd-motorbåt för att hjälpa till att ta ut beväpnade officerare för att gå ombord och säkra fartygen, och använde drönare för att dokumentera operationen.
Sea Shepherds besättning hjälpte till att dokumentera fångsten i lastrummen och rapporterade att deras fynd bekräftade misstankar om att fartygen riktade sig mot hajar med förankrade nät. Fångsten verkade vara 95 % hajar.
Samma flotta hade upptäckts i Östtimor i februari när de lastade av hajar på det kylda lastfartyget Fu Yuan Yu Leng 999, säger Sea Shepherd.
Ingen åtgärd vidtogs vid tillfället, men i augusti kvarhölls det kinesiska fartyget i Galapagos marina reservat, som rapporterats på Divernet.
Det visade sig innehålla 300 ton hajar som sägs ha lossats från Hong Long Fisheries och Pingtan Marine Enterprises fartyg. Besättningen fängslades i Ecuador och fartyget beslagtogs.
Havskrigare övervakar för närvarande den förankrade flottan, eftersom Sea Shepherd fruktar att "överenskommelser på hög nivå som görs för att frigöra dem av korrupta tjänstemän" skulle kunna göra det möjligt för fartygen att fly.
"Tråkigt nog kommer PNTL:s och Sea Shepherds goda arbete att vara förgäves och dessa tjuvskyttar kommer att undvika rättvisan ännu en gång", säger organisationens Asiendirektör Gary Stokes, som deltog i razzian.